El volante de River Plate suma nueve partidos en Copas del Mundo y está a una aparición de igualar el registro de Carlos Valderrama y Freddy Rincón como el segundo colombiano con más presencias en el torneo.
La victoria de Colombia sobre Ghana por los dieciseisavos de final del Mundial de Estados Unidos, México y Canadá 2026 representó la cuarta ocasión en que la selección colombiana alcanzó los octavos de final en siete participaciones mundialistas. El partido, disputado en Kansas City, finalizó 1-0 con un gol de Jhon Arias en el primer tiempo. La defensa colombiana evitó que Ghana realizara un tiro a puerta durante los 90 minutos.
Durante la pausa de hidratación del segundo tiempo, Arias fue reemplazado por Juan Fernando Quintero. Con ese ingreso, el volante de River Plate alcanzó su noveno partido en una Copa del Mundo, quedando a una aparición de igualar la marca de Carlos Valderrama y Freddy Rincón como el segundo futbolista colombiano con más encuentros en el torneo. Ambos jugaron en Italia 1990, Estados Unidos 1994 y Francia 1998, siendo titulares en cada uno de esos partidos.
Quintero debutó en Mundiales en Brasil 2014, cuando ingresó al minuto 53 ante Costa de Marfil en reemplazo de Víctor Ibarbo. Diecisiete minutos después, anotó el 2-0 definitivo, su primer gol con la selección mayor. Fue titular luego ante Japón y no volvió a jugar en ese torneo, donde Colombia llegó a cuartos de final y fue eliminada por Brasil 2-1.
En Rusia 2018, Quintero abrió el marcador ante Japón con un tiro libre que pasó por debajo de la barrera, en un partido que Colombia perdió 2-1. Ese gol fue elegido como el segundo mejor del torneo. En los partidos ante Polonia y Senegal, dio dos asistencias, una para Radamel Falcao García y otra para Yerry Mina, que permitieron a Colombia ganar el Grupo H. La campaña terminó en octavos de final con derrota ante Inglaterra en penales tras un empate 1-1.
En el Mundial 2026, Quintero ha tenido un rol de recambio. No jugó en el triunfo 3-1 ante Uzbekistán. Ingresó al minuto 58 ante República Democrática del Congo y generó el espacio para el gol de Daniel Muñoz. Ante Portugal entró al minuto 76 en un partido que terminó 0-0. Frente a Ghana, ingresó al minuto 73 y realizó un disparo de larga distancia al minuto 84 que no fue gol.